El període històric d'Egipte va començar al canvi del tercer i quart mil·lenni abans del naixement de Crist. L'antiga tradició cultural, sotmesa a la influència d'invasors i trastorns interns, va perdurar fins a l'adopció del cristianisme al segle IV dC. Durant gairebé tres mil anys i mig, la llista i les funcions dels déus egipcis han sofert canvis significatius. Els déus egipcis van adquirir trets i noms característics dels seus veïns: assiris, hitites, hiksos i hel·lens.
Després de la unificació d'Egipte sota el domini d'un sol governant, molts déus de regions i tribus individuals del país van entrar al panteó comú, però la majoria d'ells només van ser venerats a l'entorn on es va originar el seu culte. Alguns déus van adquirir gradualment un significat egipci comú. La deessa Bastet, que té un cap de gat, va sorgir sens dubte d'un culte a la veneració dels gats com a guardians de les reserves de gra dels ratolins. L'agricultura va tenir un paper important a Egiptepaper, a diferència, per exemple, de l'Hèlade, que va augmentar principalment a causa del comerç i les conquestes militars. Els déus egipcis antropomòrfics sovint eren dotats amb el cap d'un animal, sobre la base de la veneració de la qual va sorgir aquest o aquell culte. Per exemple, el déu Thoth tenia el cap d'un ibis, la deessa Sokhmet (Sekhmet) tenia el cap d'un lleó, Anubis tenia el cap d'un gos.
A mesura que determinades zones del país van augmentar, es va produir un canvi de dinasties o el "trasllat" de la capital a un nou lloc, els déus egipcis del "primer esglaó" també van canviar. Una característica interessant de l'antiga religió egípcia va ser la presència d'un gran nombre de mites cosmogònics (és a dir, versions de l'origen del món), i a cada localitat la deïtat local va jugar el paper principal en aquest difícil assumpte.
Els déus egipcis en nombre tan gran, convertint-se en la base del separatisme local, sens dubte, no els necessitava cap país. A més, nombrosos cultes requerien la despesa d'una gran quantitat de recursos materials, que es podien gastar amb molt més benefici en l'ordenació interna del país, en el manteniment de l'exèrcit, etc. I amb una gran riquesa i influència, els clans sacerdotals van amenaçar directament l'únic poder del faraó.
Tenint en compte, el faraó Amenhotep IV, prenent el nom d'Akhenaton, introdueix el culte d'una deïtat regional menor Aton (el disc solar divinitzat) com a religió egípcia comuna. Però la inèrcia de la tradició era massa forta, i Akhenaton mor abans d'arribar als quaranta anys. Segons la versió més convincent, ho eraenverinat. És cert que la persecució no va tocar la família, i la seva dona (la famosa Nefertiti) va romandre viva molts anys després de la mort del seu marit.
Després dels perses i més tard de la presa de possessió del país per part dels hel·lènics, els déus i deesses egipcies comencen a perdre gradualment la seva influència anterior, cauen en decadència. Es fusionen amb els déus dels invasors. Per exemple, Alexandre el Gran era venerat a Egipte com el fill de Zeus-Amon, una deïtat egipcio-hel·lenística sincrètica.
Quan els déus egipcis, els noms dels quals tenien un origen tant local com mixt, van començar a donar pas a una nova religió: el cristianisme, va començar l'oblit de l'escriptura egípcia antiga. Durant el regnat de l'emperador Constantí, va morir l'últim portador de la tradició religiosa egípcia, després de la qual cosa durant molts segles els noms dels antics déus egipcis només es coneixien pels escrits dels historiadors grecs i romans. Però tots dos es van familiaritzar amb la cultura egípcia en un moment en què ja estava minvant, i és poc probable que els sacerdots iniciïn estranys (sovint agressius) als secrets de la seva religió.
Tant científics àrabs com europeus van fer intents repetits de desxifrar els jeroglífics antics, però sense èxit. I només a principis del segle XIX, el genial lingüista Francois Champollion va aconseguir trobar la clau per desxifrar els textos egipcis. A partir d'aquest moment, va començar l'era moderna d'estudiar la història i la cultura de l'Antic Egipte.
